微波殺菌設備，是利用了電磁場的熱效應和生物效應的共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變化，使細菌失去營養，繁殖和生存的條件而死亡。微波對細菌的生物效應是微波電場改變細胞膜斷面的電位分布，影響細胞膜周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此營養不良，不能正常新陳代謝，細胞結構功能紊亂，生長發育受到抑制而死亡。此外，微波能使細菌正常生長和穩定遺傳繁殖的核酸和脫氧核糖核酸，是由若干氫鍵松弛，斷裂和重組，從而誘發遺傳基因突變，或染色體畸變甚至斷裂。
微波殺菌效果是不錯的，微波的生物效應和非生物效應共同作用，殺菌效果很明顯。目前微波殺菌用途很廣泛，一般在食品、醫藥上有很大的優勢。
微波殺菌設備的特點：
1、時間短、速度快
2、低溫殺菌保持營養成分和傳統風味
3、節約能源
4、均勻
5、便于控制
6、設備簡單，工藝可靠
微波殺菌設備優點：常規的真空干燥設備都采用蒸汽進行加熱，需要從里到外進行加熱，加熱速度慢需要耗費大量的煤，而微波醫藥真空干燥設備采用的是電磁波加熱，無需傳熱媒介，直接加熱到物體內部，升溫速度快，避免了上述缺點，速度快、效率高、干燥周期縮短，能耗降低。與常規干燥技術相比可提高工效，加熱均勻，由于微波加熱，是從內到外對物料進行同時加熱，物料的內外溫差很小，不會產生常規加熱中出現的內外加熱不一致的狀況，從而產生膨化的效果，利于粉碎，使干燥質量得到提高。
